Las dos cadenas de ADN son antiparalelas, por tal razón la ADN polimerasa puede solamente sintetizar un nuevo ADN en la dirección 5' a 3'. Esto produce problemas especiales para replicar una doble cadena de ADN.
En la cadena de arriba, la primasa sintetiza un ARN base en la dirección 5' a 3'.
La primasa se va, y la ADN polmerasa agrega nucleótidos de ADN al ARN base en la dirección 5' a 3'. En E. coli la enzima usada es la ADN polimeraasa III. Este nuevo ADN es llamada cadena retrasada, debido a que es elaborada en la dirección opuesta al movimiento de la bifurcación de replicación. El segmento producido se le conoce también por fragmento de Okazaki.
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